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中国医学科学院医学实验动物研究所10x转录组建库测序分析项目比价采购公告

2022年09月23日 来源:

中国医学科学院医学实验动物研究所10x转录组建库测序分析采购项目进行比价采购,诚邀具备相应资质的供应商前来参加。

  • 项目名称:中国医学科学院医学实验动物研究所10x转录组建库测序分析采购项目
  • 预算金额:36万元
  • 采购内容:10x转录组建库测序分析
  • 采购品目:服务
  • 采购需求概括:

10x Genomics的Chromium Controller是基于微流控技术的单细胞分选系统,针对单个样本可以获得5,00-10,000的单细胞油包水液滴,随后配套试剂可用于制备单细胞转录组文库和Illumina测序平台兼容,最后通过测序实现对高通量单细胞数据进行细胞群体的分类以及细胞群体间基因表达的差异分析。15例组织样品,每个样品预计捕获10000个细胞,由完成10xGenomics单细胞转录组文库建库测序分析。对文库进行illumina NovaSeq 6000 高通量测序,共构建15个文库,每个文库提供150Gb raw data的测序数据。根据物种特点调整软件和参数设置,对转录组测序数据进行生物信息学分析。

标准分析:

1)测序质量评估;

2)  Cell Ranger分析:基因表达量分析,细胞群体分析;

3)  Seurat分析:数据质控,细胞聚类,细胞类型鉴定,差异表达基因分析;

4)  差异表达基因GO统计,GO富集分析,GO富集DAG图;

5)  差异基因KEGG分析;

6)  差异基因蛋白互作网络分析;

7)  比较分析:marker基因分析;

8)  拟时间分析。

高级分析:

1)单细胞亚群注释分析

2)RNAvelocyto速率分析

3)CopyKAT基因组拷贝数推断分析

4)inferCNV基因组拷贝数推断分析

5)细胞通讯SingleCellSignalR分析

6)细胞通讯iTALK分析

7)SCENIC转录因子调控网络分析

8)辅助细胞定义分析

9)pyANNOSC分析(视细胞数规模而定)

个性化分析:

所有数据整理类的个性化分析

投标人需配备有严格的质量控制体系,拥有ISO9001质量体系认证,ISO14001质量体系认证,ISO45001质量体系认证,15189实验室认可证书,具有样品及数据处理的高效成熟的软件、流程。配备有最新测序服务设备(2016年后购入),质量控制体系科学、完整。

  • 预计采购时间:2022年10月
  • 合格供应商的资格要求:

(一)具有独立承担民事责任的能力;具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录;法律、行政法规规定的其他条件;

(二)供应商必须是在中华人民共和国境内注册,具有独立法人资格的单位或其他组织;

(三)如国家对本项目相关专业有特别规定或资质要求,则必须符合相关规定或具有相关资。

  • 比价响应:

(一)送达时间:请于2022年9月27日之前

(二)方式:发送至后勤管理办公室邮箱houqin@cnilas.org

(三)报价文件请按送达时间要求由本项目授权代表准时送达,请递交相关人员联系方式,产品报价、本公司营业执照、资质及相关证件,并填写《采购供应商廉洁承诺书(动研所)》。

(四)提早、逾期收到或不符合规定的比价响应文件恕不接受。

(五)缺少相关文件或缺少《采购供应商廉洁承诺书(动研所)》不予采纳。

  • 相关单位信息:

采购单位:中国医学科学院医学实验动物研究所

地    址:北京市朝阳区潘家园南里5号

联 系 人:李老师

联系电话:010-67770826

 

 

附件:采购供应商廉洁承诺书(动研所)