中国医学科学院医学实验动物研究所单细胞转录组测序技术服务采购项目比价采购公告
中国医学科学院医学实验动物研究所单细胞转录组测序技术服务采购项目进行比价采购,诚邀具备相应资质的供应商前来参加。
- 项目名称:中国医学科学院医学实验动物研究所单细胞转录组测序技术服务采购项目
- 预算金额:14.4万元
- 采购内容:单细胞转录组测序技术服务
- 采购品目:服务
- 采购需求概括:
(根据课题研究内容,进行3’单细胞转录组测序(PE150),数据量150G,需进行样本制备(单细胞制备)、建库、测序及基本分析。根据测序结果进行高级分析。技术服务预算为14.4万元。
(一)技术参数
1. 10X Genomics人组织单细胞mRNA测序
2. 样本数:6例
3. 具有全面的单细胞活性检测指标,保证单细胞的质量
4. 构建单细胞mRNA测序文库时,细胞活性≥80%,细胞数量≥5x105个,细胞浓度在700-1200个cell/ml
5. 采用10X Genomics的单细胞建库仪器及原装配套试剂进行单细胞文库的构建
6. 细胞数量≥5000个/sample,数据量≥150G clean data/sample
7. 二代高通量测序Illumina NovaSeq 6000平台,测序读长 PE150。
8. 测序质量:clean data Q20≥90%,Q30≥85%
9. 供应商提供以下标准信息分析内容,包括:
1)有效Barcode统计,测序饱和度统计;
2)基本数据分析,细胞数目统计,单个细胞reads数目统计等;
3)基因表达定量,获得表达基因及其表达量数据;
4)聚类分析,提供tSNE聚类分析结果;
5)差异基因分析,针对不同cluster 中的基因进行差异分析。
6)差异基因功能富集,包括GO和KEGG;Reactome(仅限于人和小鼠)
7)差异基因 TF 注释
10. 供应商应具备但不限于以下个性化分析能力:
1)细胞分群注释,对不同细胞亚群进行辅助定义;
2)拟时分析,预测细胞演化/分化过程;
3)受配体分析,分析细胞之间的相互作用;
4)目标亚群进一步分析,针对关注细胞亚群进一步分析;
5)多组学整合关联分析,与蛋白组、表观组等数据关联分析。
11. 此项目对测序质量和测序通量要求较高,供应商需自主拥有20台以上NovaSeq 6000高通量平台的测序仪器设备,不允许外包其他供应商,能够固定2台仪器优先本项目使用。
12. 此项目对细胞活性要求较高,供应商需自主拥有5台及以上10XGenomics的单细胞建库仪器设备,并提供上门服务,不允许外包其他供应商。
13. 供应商需具备高性能计算平台,总内存300TB以上,总存储20PB以上。
14. 为保证项目的测序质量,供应商具有有效的资质认证,包括但不限于ISO9001质量体系认证、高新技术企业证书等。
15. 供应商需具有充足的项目经验和专业技术人员,有能力保证本项目的顺利开展;具备客服部,且一周七天均可对采购人相关人员的问题进行实时响应;
(二)质量要求
1. 构建单细胞mRNA测序文库时,细胞活性≥80%,细胞数量≥5x105个,细胞浓度在700-1200个cell/ml
2. 细胞数量≥5000个/sample,数据量≥150G clean data/sample
3. 测序质量:clean data Q20≥90%,Q30≥85%
(三)功能目标
通过每个细胞的转录本 3’端的转录组信息,在转录组的层面展开细胞类型分群、信 号通路差异响应、分子调控网络、细胞异质性等方面的研究。
(四)服务周期
1. 项目完成期限:自样本检测全部合格,项目启动之日起30个自然日之内必须完成全部检测项目。
2. 数据存储时间:1个月以上,供应商需提供移动硬盘用于数据传输。
(五)验收指标
为使测序服务项目按照标准要求进行,确保项目结题后达到招标文件要求和标准,并能正常投入后期实验要求,供应商按相关要求协助我方进行项目验收。我方按照约定测序数据量,保证所提供的资料、数据真实可靠。
在总数据量达标的情况下(1G),利用fastQC系统检查每个文库数据量不低于目标数据量的90%,平均Q20≥90% ,平均Q30≥85%。
- 预计采购时间:2023年3月
- 合格供应商的资格要求:
(一)具有独立承担民事责任的能力;具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录;法律、行政法规规定的其他条件;
(二)供应商必须是在中华人民共和国境内注册,具有独立法人资格的单位或其他组织;
(三)如国家对本项目相关专业有特别规定或资质要求,则必须符合相关规定或具有相关资。
- 比价响应:
(一)送达时间:请于2023年2月28日之前
(二)方式:发送至后勤管理办公室邮箱houqin@cnilas.org
(三)报价文件请按送达时间要求由本项目授权代表准时送达,请递交相关人员联系方式,产品报价、服务设计方案、组织机构代码证、企业税务登记证、近三年内同类项目合同(3份以上)复印件、无条件接受违法违规行为公示承诺书、本公司营业执照、资质及相关证件,并填写《采购供应商廉洁承诺书(动研所)》。
(四)提早、逾期收到或不符合规定的比价响应文件恕不接受。
(五)缺少相关文件或缺少《采购供应商廉洁承诺书(动研所)》不予采纳。
- 相关单位信息:
采购单位:中国医学科学院医学实验动物研究所
地 址:北京市朝阳区潘家园南里5号
联 系 人:李老师
联系电话:010-67770826