1998年，“猴爱滋病SIV模型的建立和在中药实验治疗中的应用”获国家科委科技成果奖； 2003年，“老年性痴呆转基因动物（APP）模型的建立及应用”获中华医学会三等奖； 2004年，“SARS冠状病毒感染恒河猴等动物的模型建立”获北京市科学技术奖二等奖； ......

　人类的工业化进程加剧了环境的污染，其中空气污染导致心血管疾病、中风、慢阻肺等疾病的上升。室内环境作为人生活的主要场所同时收到室内污染、室外污染和居民三者的共同作用。研究室内环境对提高人生活品质有重要意义。室内环境中的化学污染物种类随着工业的发展成指数增长，而关于室内环境污染下，微生物的进化规律却研究滞后，我们将专注于主要挥发性污染物与微生物的关系，并利用线虫、无菌动物建立评价室内微生物环境的方法。此外，我们利用多种动物模型对于主要的空气污染物PM2.5的生物危害和机制进行挖掘。随着我国深空探测工程的进行，如何在外太空环境中保证宇航员的健康是一个关键问题。我们课题组利用三维随机定位回旋仪模拟微重力效应，通过不同的动物模型来研究失重环境下的生理变化及其机制（心血管功能失调、肌肉萎缩、失重性骨质流失、免疫功能下降、航天贫血症和空间运动病等）；宇宙辐射对健康的危害（肿瘤发生、白内障等）；长期幽闭环境对心理的影响（空间乘员心理相容性、环境心理适应性等）等。

自2019年12月新型冠状病毒感染的肺炎疫情发生以来，中国医学科学院医学实验动物研究所承担了科技部科技攻关任务“2019-nCov动物模型构建”项目。疫情科技防控成功的关键之一，在于动物模型，因为动物模型是评价疫苗和筛选药物、研究致病机制和传播途径的必需工具，没有这个工具，疫情的科技攻关成果就只能埋没于实验室，无法应用于临床。