2004
- 1月5日国家863重大专题《SARS冠状病毒感染恒河猴等动物的模型建立》研究课题，通过卫生部组织的专家鉴定委员会鉴定，被誉为“具有重要的理论意义和实际应用价值，研究成果处于国际领先水平”。
- 3月8日所长秦川教授获得北京市及全国“三八”红旗手光荣称号。
- 3月15日“中国实验动物学报”“中国实验动物学杂志”被收录为国家科技部“中国科技论文统计源期刊”（中国科技核心期刊）。
- 4月14日研究所学委会换届改选，同时成立实验动物福利与伦理委员会，秦川教授任学委会主任和实验动物福利与伦理委员会主任委员。
- 4月21日CALAS第六届学术年会在杭州召开。会上，CALAS第四届理事会换届改选，所长秦川教授当选副理事长兼秘书长。
- 5月19—27日应日本实验动物学会邀请，国内实验动物界专家、学者及管理人员组成学术代表团，对日本进行访问。CALAS与日本、韩国实验动物学会共同倡议成立了“亚洲实验动物学会联合会”（以下简称“AFLAS”），CALAS秘书长秦川教授代表中国参加了AFLAS理事会，当选为AFLAS副主席。
- 5月27日朱华获得日本实验动物学会颁发的“日本实验动物国际奖”。
- 10月15日研究所党委进行换届改选。经医科院党委批准，新一届党委由游德通、万泽军、刘云波、秦川、涂新明等五名同志组成；游德通任党委书记。
- 10月18日研究所与法国巴黎第五大学癌症疫苗研究所正式签署了共同合作开展“中国猕猴SIV疫苗的研究与开发”协议书。
- 10月29日经“卫生部职业技能鉴定指导中心”批准，研究所取得了培训工作的资格，即《医学实验动物饲养国家职业资格》。
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